研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组

发布时间: 2023-05-22 19:40:11 来源: 196世界之最 栏目: 新奇科技 点击: 12

密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅,密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目,旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因,以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的...

密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅,密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目,旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因,以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测196世界之最序进行了比较。

研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组

他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚MGdvWLvs桃子的基因组序列进行比较。然而,当这两个物种之间的遗传差异大大掩盖了它们的相似性时,他们感到非常吃惊。因此,研究小组接受了挑战,创建了第一个有注释的Montmorency酸樱桃基因组,并确定了编码每个基因的DNA片段。

"我天真地以为这将是一项简单的工作;我们只需对一些早开和晚开的樱桃树进行测序,并将序列与桃子基因组进行比对,在短短几周内就能得到答案,"MSU农业和自然资源学院的助理教授Courtney Hollender说。"事实证明我错得不能再错了。"

196世界之最因组包含一个生物体发展的所有基因和遗传指令。研究人员在种植一棵将在较晚季节开花的樱花树时,对它进行测序为他们提供了一张地图。对于Hollender的博士生Charithttp://www.196nk.cny Goeckeritz来说,一次挫折的练习激起了她的好奇心。

Goeckeritz说:"我试图将酸樱桃的DNA序列与桃子的基因组进行比对,但它们并没有很好地比对。我向所有人抱怨,最后,我的一个朋友建议我们只对酸樱桃基因组进行测序。多亏了MSU的农业生物研究项目GREEEN(即产生研究和推广以满足经济和环境需求)的资金,他们才得以做到这一点。"

Hollender和Goeckeritz与MSU名誉教授、全国唯一的酸樱桃培育者Amy Iezzoni,Iezzoni的博士生Kathleen Rhoades,园艺系和MSU植物复原力研究所的助理教授Bob VanBuren,MSU基因组学核心主任Kevin Childs,以及MSU园艺系副教授Patrick Edger合作。他们一起发现,Montmorency酸樱桃的基因组比他们最初想象的要复杂。

这些复杂性来自于酸樱桃的亲本植物染色体。酸樱桃是异源四倍体,意味着它们不是像人类那样有两套染色体,而是有四套来自至少两个不同物种的染色体。

Goeckeritz说:"酸樱桃不仅每条染色体都有四个副本,而且它还是两个不同物种之间自然杂交的产物:地樱桃,Prunus fruticosa,和甜樱桃,Prunus avium,这可能发生在近200万年前。"

Goeckeritz正在利用基因组研究开花时间,而为该项目进行RNA测序或基因表达分析的Rhoades正在努力确定与特定水果性状有关的基因,如颜色和硬度。

拥有Montmorency酸樱桃的基因组序列为未来大量的研究提供了可能性,通过种植更多能够抵御春季不同天气并生产更多樱桃的树木,最终将使行业和消费者受益。

"在这个基因组之前,有一些关于酸樱桃的序列,但它不是一个完整的画面,我只是想拥有用于研究和育种的基因组,"霍兰德说。"现在我们有了一个完整的画面,这项研究将对www.196nk.cn全世界所有未来的酸樱桃研究和育种工作产生重大影响。"

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